Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc4Q3UP24 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms