Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp30Q3UN04 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms