Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms