Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULJ3

Upf3a, MCG3697, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf3aQ3ULJ3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upf3aQ3ULJ3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms