Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp19Q3UJD6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms