Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms