Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms