Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Puf60Q3UEB3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Puf60Q3UEB3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms