Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms