Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc174Q3U155 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms