Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms