Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms