Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Usp39Q3TIX9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Usp39Q3TIX9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp39Q3TIX9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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