Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afvQ3THW5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms