Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD49

Sppl2b, Signal peptide peptidase-like 2B, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2bQ3TD49 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sppl2bQ3TD49 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms