Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M3Q31093 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms