Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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