Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Traf3ip1Q149C2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3ip1Q149C2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms