Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Perm1Q149B8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms