Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b1Q148W0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b1Q148W0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms