Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

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Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VgfQ0VGU4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
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VgfQ0VGU4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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VgfQ0VGU4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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VgfQ0VGU4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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VgfQ0VGU4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VgfQ0VGU4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms