Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc162pQ0VG85 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms