Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms