Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc7a1Q09143 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms