Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms