Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
MitfQ08874 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms