Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms