Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms