Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ebf1Q07802 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ebf1Q07802 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ebf1Q07802 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ebf1Q07802 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ebf1Q07802 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ebf1Q07802 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ebf1Q07802 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ebf1Q07802 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ebf1Q07802 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ebf1Q07802 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ebf1Q07802 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ebf1Q07802 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ebf1Q07802 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ebf1Q07802 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ebf1Q07802 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ebf1Q07802 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ebf1Q07802 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ebf1Q07802 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ebf1Q07802 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ebf1Q07802 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ebf1Q07802 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ebf1Q07802 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ebf1Q07802 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ebf1Q07802 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ebf1Q07802 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ebf1Q07802 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ebf1Q07802 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ebf1Q07802 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ebf1Q07802 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ebf1Q07802 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms