Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Siah2Q06986 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms