Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aplp2Q06335 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms