Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPINDOCQ05AH6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms