Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top1Q04750 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top1Q04750 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top1Q04750 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms