Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pfdn6Q03958 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms