Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GscQ02591 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GscQ02591 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GscQ02591 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GscQ02591 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GscQ02591 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GscQ02591 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GscQ02591 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GscQ02591 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GscQ02591 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GscQ02591 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GscQ02591 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GscQ02591 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GscQ02591 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GscQ02591 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GscQ02591 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GscQ02591 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GscQ02591 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GscQ02591 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GscQ02591 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GscQ02591 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GscQ02591 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GscQ02591 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GscQ02591 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GscQ02591 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GscQ02591 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GscQ02591 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GscQ02591 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GscQ02591 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GscQ02591 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GscQ02591 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GscQ02591 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GscQ02591 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GscQ02591 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GscQ02591 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GscQ02591 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GscQ02591 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GscQ02591 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GscQ02591 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GscQ02591 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GscQ02591 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GscQ02591 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GscQ02591 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GscQ02591 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GscQ02591 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GscQ02591 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GscQ02591 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GscQ02591 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GscQ02591 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GscQ02591 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GscQ02591 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GscQ02591 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GscQ02591 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GscQ02591 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GscQ02591 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GscQ02591 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GscQ02591 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GscQ02591 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GscQ02591 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GscQ02591 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GscQ02591 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GscQ02591 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GscQ02591 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GscQ02591 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GscQ02591 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GscQ02591 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GscQ02591 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GscQ02591 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GscQ02591 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GscQ02591 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GscQ02591 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GscQ02591 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GscQ02591 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GscQ02591 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GscQ02591 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GscQ02591 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GscQ02591 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GscQ02591 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GscQ02591 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GscQ02591 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GscQ02591 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GscQ02591 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GscQ02591 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GscQ02591 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GscQ02591 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GscQ02591 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GscQ02591 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GscQ02591 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GscQ02591 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GscQ02591 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GscQ02591 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GscQ02591 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GscQ02591 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GscQ02591 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GscQ02591 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GscQ02591 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GscQ02591 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GscQ02591 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GscQ02591 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GscQ02591 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms