Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nhlh1Q02576 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms