Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctnnb1Q02248 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms