Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcqQ02111 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkcqQ02111 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcqQ02111 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms