Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1cQ01815 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms