Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms