Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EgfrQ01279 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms