Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms