Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms