Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfaQ00731 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms