Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SeleQ00690 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SeleQ00690 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SeleQ00690 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms