Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scn1bP97952 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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