Protein–RNA interactions for Protein: P97950

Rab33a, Ras-related protein Rab-33A, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33aP97950 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms