Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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