Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms