Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig3P97386 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms